沸騰させたときに、カルキ臭(の大部分)が抜けますので、どちらも変わりありません。浄水器を使用するとカルキ臭が完全に無くなるので、コーヒーの味はより良くなります。
よく一緒に見られている「コーヒーを淹れるときの水は軟水と硬水で味が変わりますか。」も見てみる。
参考になりましたか?